Vilkokšnio kraštovaizdžio draustinyje saugomas Vilkokšnio ežero dubaklonio kraštovaizdis su terasomis, sufoziniais cirkais, eroziniais raguvynais, Verknės ištakomis, Žaliųjų Prūdelių ir Panošiškių šaltiniais, Žuklijų piliakalniais ir papėdės gyvenviete, Žaliosios šventviete ir pilkapių vieta, Alkaičio (Žaliosios) mitologiniu akmeniu, Tolkiškių dvaro senųjų kapinių kompleksu, Europos Bendrijos svarbos Kadagynų, Nekalkingų šaltinių ir šaltiniuotų pelkių, Šarmingų žemapelkių, Vakarų taigos, Žolių turtingų eglynų buveinėmis, saugomų augalų ir gyvūnų rūšių (plačialapių klumpaičių, dvilapių purvuolių, žvilgančiųjų riestūnių, niūriaspalvių auksavabalių, ūdrų, tulžių, didžiųjų baublių, pievinių lingių, griežlių, švygždų) populiacijomis ir buveinėmis.