Merkinės pilis „Merkenpille“, „Merkenpil“ Kryžiuočių kelių aprašymuose ir kronikose minima nuo 1377 m. Pilis Merkio, Nemuno ir Stangės upių santakoje stovėjo ant stačiašlaitės kalvos 1200 kv. m plote ir buvo viena svarbiausių Lietuvos Didžiojoje Kunigaikštystėje. Strateginis trikampis Vilnius – Kaunas – Merkinė tuo metu sudarė pagrindinę Lietuvos gynybos sistemą, kurios atraminiai punktai miškingame krašte tarpusavyje buvo susieti vandens keliais (Nemunu, Nerimi, Merkiu, Voke). Šiaurinė piliakalnio dalis 1930 m. nugriuvo paplovus vandens malūno, stovėjusio ant Stangės upelio, tvenkinio vandeniui. Nuo Merkinės piliakalnio atsiveria vienas gražiausių Lietuvos kraštovaizdžių – Merkio ir Nemuno santaka.