Im Regionalpark Stausee Kaunas wird die Landschaft des Unterlaufs des Stausees Kaunas geschützt. Unter Schutz stehen dadurch:

• die komplexe Landschaft um den Stausee Kaunas mit großen Aufschlüssen und den überfluteten Zuflüssen des Nemunas;
• das Ensemble des Klosters Pazaislis und das ethnographische Freilichtmuseum in Rumsiskes;
• die Stabilität des Ökosystems, der biotischen Komponenten, die spezifische Pflanzen- und Tierwelt, wichtige Plätze für das Brüten von Wasservögeln und Rastplätze für Zugvögel.

Der Stausee ist das größte künstliche Gewässer in Litauen (460 Mio. m3, 63,5 km2, etwa 0,1% der Landesfläche), das das breite Tal mit den Schleifen des Nemunas geflutet hat und relativ naturbelassene Steilufer aufweist (bis zu 40 m hoch), Uferstreifen, teils offene teils halboffene Landschaften. Besondere Vergangenheit und ausdrucksvolle Landschaft, die durch das Wasser des Stausees verändert werden. Zahlreiche Aufschlüsse, Täler der Zuflüsse, die zu Fjorden geworden sind, Fragmente von Urwald, die herrlichen Türme der Klosterkirche Pazaislis. Besonders wertvoll ist die Wacholderheide am Steilhang Arlaviskes. In diesem Regionalpark befindet sich das einzige Arboretum von Litauen, in Dubrava, hier befindet sich das riesige ethnographische Freilichtmuseum und nur hier wächst die Raue Nelke.

Die Landschaft des Regionalparks Stausee Kaunas zeichnet sich durch eine besondere morphologische Struktur aus und durch ein charakteristisches Kulturerbe und ein beachtliches Potenzial für Erholung und Bildungstourismus.

Die Vielfalt der Landschaft des Regionalparks besteht aus diesen wichtigsten Landschaftstypen: überflutetes breites Tal mit ehemals Flussmäandern, bewaldete Steilufer mit Aufschlüssen, bewaldete Sporne, relativ naturbelassene Täler der Nebenflüsse, bewaldete Kerbtäler, bewaldete sandige Ebenen und Hügelland, Niedermoore, energietechnische Bauwerke.

Von der Europäischen Union geschützte Lebensraumtypen (Bezeichnung und EU-Code): 5130 Wacholderheiden, 6210 Kalktrockenrasen, 7220 Kalktuffquellen, 8220 Aufschlüsse von Silikatgestein, 9010 Westliche Taiga, 9050 Krautreiche Fichtenwälder, 9070 Waldweiden, 9180 Schlucht- und Hangmischwälder.

Die Gesamtzahl der Pflanzenarten liegt bei 950, davon sind 2 von der EU geschützt und 30 sind in die Rote Liste von Litauen aufgenommen. Die Gesamtzahl der Tierarten beträgt 600. 50 Säugetiere, von denen 4 von der EU geschützt sind und 8 in die Rote Liste von Litauen aufgenommen wurden. 220 Vögel, von denen 39 von der EU geschützt sind und 25 in die Rote Liste von Litauen aufgenommen wurden. 34 Fische, von denen 2 von der EU geschützt sind und 3 in die Rote Liste von Litauen aufgenommen wurden. 16 Amphibien und Reptilien, von denen 2 von der EU geschützt sind und 3 in die Rote Liste von Litauen aufgenommen wurden. 310 Wirbellose, von denen 2 von der EU geschützt sind und 5 in die Rote Liste von Litauen aufgenommen wurden.

Zur Bewahrung der natürlichen und kulturellen Schätze des Regionalparks Stausee Kaunas wurden 14 Schutzgebiete (2 Landschaftsschutzgebiete, 3 hydrographische, 3 botanisch-zoologische, 1 ornithologisches, 1 botanisches, 2 architektonische und 2 archäologische) ausgewiesen.

In den Landschaftsschutzgebieten steht unter Schutz: Stausee Kaunas – der Zentralbereich des Stausees mit den hohen Ufern des Flusstals und den großen Aufschlüssen am Wald von Rumsiskes, die typischen Hangwälder, archäologische Werte (Burghügel Samylai mit Siedlungsresten, Burghügel Samylai II, Gutshof Virsuziglis, Hügelgräber und Burghügel von Dovainonys und Kapitoniskes), das Streudorf Kapitoniskes mit seiner Siedlungsstruktur; Streva – das reizvolle Tal des Unterlaufs der Streva mit den Auenwäldern, FFH-Lebensraumtypen (Schlucht- und Hangmischwälder, Kalktrockenrasen, artenreiche trockene Rasen), Burghügel Lasiniai mit Siedlungsresten. In den hydrographischen Schutzgebieten steht unter Schutz: Karciupis – das naturbelassene Flüsschen Karciupis und seine Zuflüsse, nach Struktur und Art der Landschaft; Praviena – das Flüsschen Praviena mit Zuflüssen; Uole – die Bucht Uole, die durch Aufstauen des Nemunas entstanden ist, natürliche Form der Landschaft.

In den botanisch-zoologischen NSG steht unter Schutz: Dabinta – zwei verschiedene Vegetationskomplexe, zum einen ein hundertjähriger Kiefernwald, zum anderen das bewachsene sumpfige Ufer des Stausees und die Insel Dabinta, seltene Vogelarten (Schwarzmilan, verschiedene Spechte, Hohltaube) mit ihren Brutplätzen, seltene Pflanzen (Sand-Nelke, Wald-Klette, Weinberg-Lauch); Gastilionys – typischer Wald der Flussaue, See Paezeris, FFH-Lebensraumtypen (Krautreiche Fichtenwälder, Laubholz-Bruchwälder, Hainbuchenwälder, Moorwälder, Hemiboreale Mischwälder), geschützte Vogelarten (Seeadler, Schwarzmilan, Habicht, Schreiadler) und der in Litauen besonders seltene Säuger Siebenschläfer; Piliuona – Bereich der unteren Terrasse des Tals des Nemunas mit zahlreichen Auwiesen, Feuchtgebieten verschiedener Art und Größe, seltenen Vogelarten (Alpenstrandläufer, Kampfläufer, Rotschenkel, Großer Brachvogel) und deren Brutplätzen, seltene Pflanzen (Fleischfarbenes und Baltisches Knabenkraut, Männliches Knabenkraut, Blaue Himmelsleiter, Wiesen-Siegwurz, Borstige Glockenblume).

Im botanischen NSG Arlaviskes stehen FFH-Lebensräume an den Hängen zum Stausee unter Schutz (Wacholderheide, Kalktrockenrasen, Kalktuffquellen, Schlucht- und Hangmischwälder), seltene und gefährdete Pflanzenarten (Filz-Glockenblume, Kreuzenzian, Weinberg-Lauch, Raue Nelke).

Im ornithologischen NSG Arlaviskes stehen unter Schutz die Vogelarten (Rohrdommel, Kleines Sumpfhuhn, Tüpfelsumpfhuhn, Wasserralle, Drossel- und Teichrohrsänger, Blässhuhn, Lappentaucher, Rohrweihe, Löffelente, Schnatterente, Moorente).

In den architektonischen Schutzgebieten steht unter Schutz: V. Fort der Festung Kaunas – Territorium des V. Forts des zweiten Rings der Festungsanlagen von Kaunas vom Ende des 19., Beginn des 20. Jahrhunderts als Denkmal von Technik und Architektur; Pazaislis – Denkmal des litauischen Barocks des 17. und 18. Jh., das Kamaldulenser-Kloster Pazaislis mit der Barockkirche, den Flügeln des Klosters, Gästehaus, Einsiedlerklausen, Wohngebäuden, Brunnen, Turm und weiteren Nebengelassen und die landschaftlich reizvolle Umgebung.

In den archäologischen NSG steht unter Schutz: Verteidigungsanlagen Palemonas – Festungsbauten aus dem Zeitraum vom 15. bis zu Beginn des 20. Jahrhunderts, Reste des Eisenbahn-Forts (Palemonas) mit einer Reihe von Blindagen, dem Burghügel Vieskunai und Siedlungsresten; Surgantiske – ein Territorium mit einer beeindrucken Ansammlung archäologischer Objekte (Burghügel Maisiejunai mit Siedlungsresten und Hügelgräbern von Maisiejunai (Surgantiskes)).

Im Regionalpark Stausee Kaunas gibt es 15 Objekte des Naturerbes, 1 davon als Naturdenkmal. Im Regionalpark befinden sich 35 Objekte des Kulturerbes, von denen 8 als Kulturdenkmal klassifiziert sind.