ADer Regionalpark Anyksciai wurde gegründet, um Folgendes zu schützen:

• das Tal der Sventoji mit zahlreichen Altarmen, erodierten Nebentälern und Umlaufbergen; der Kar von Kurkliai; den Wald Anyksciai silelis mit den Schwemmwiesen am Fluss und dem Moorsee Budragaidis; die Seenplatte Rubikiai und Musejus mit Inseln; die Alttäler von Anyksta und Virinta; die Moräne der Wasserscheide Storiai;
• Kulturerbe, darunter die Burghügel Seimyniskeliai, Liudiskiai, Piliakalnis, Buivydys, Bijeikiai, den Gutshof Burbiskis und die Altstadt von Anyksciai;
• die Stabilität von Ökosystemen und Elementen der Biotope, spezielle Pflanzen und Tiere, die natürlichen Migrationswege und Laichplätze von Fischen.

Der Regionalpark hat eine recht gemischte Landschaft, die sich durch hohes Potenzial für Bildungstourismus und Erholung auszeichnet. Er befindet sich in einem Übergangsbereich zwischen der mittellitauischen Ebene mit zahlreichen Tälern und dem baltischen Rücken. Nach der Bewertung der Komplexität der Landschaften gehört der Regionalpark Anyksciai zur höchsten Kategorie.

Die landschaftliche Vielfalt des Regionalparks umfasst solche Landschaftstypen wie Flusstäler mit zahlreichen Flussterrassen, die oft bewaldet und nicht urbanisiert sind und kaum intensiv genutzt werden, mit tief eingegrabenen Seitenbächen, wellige Wälder fluvioglazialen Ursprungs, waldbestandene Erosionstäler und Kare, Erhebungen und Hänge in landwirtschaftlicher Nutzung, Moränenhügel, große Seen und die Stadt, die in einem attraktiven Tal am Fluss gewachsen ist.

Von der Europäischen Union geschützte Lebensraumtypen (Bezeichnung und EU-Code) 9010 Westliche Taiga, 7140 Übergangs- und Schwingrasenmoore, 6210 Naturnahe Kalktrockenrasen, 3260 Flüsse der planaren Stufe mit Wasserhahnenfuß, 6450 Nordboreale Auenwiesen, 8220 Silikatfelsen mit Felsspaltenvegetation. Die Gesamtzahl der Pflanzenarten liegt bei 769, davon sind 4 von der EU geschützt und 33 in der Rote Liste von Litauen. Die Gesamtzahl der Tierarten beträgt 70. Davon sind 5 Säugetiere, von denen 3 von der EU geschützt sind und 2 in die Roten Listen von Litauen aufgenommen wurden. 23 Vogelarten, von denen 11 von der EU geschützt sind und 12 in die Roten Listen von Litauen aufgenommen wurden. 35 Fischarten, von denen 4 von der EU geschützt sind. 3 Amphibienarten, von denen 1 von der EU geschützt ist und 2 in die Rote Liste von Litauen aufgenommen wurden.

Zur Bewahrung der natürlichen und kulturellen Schätze des Regionalparks Anyksciai wurden 1 Totalreservat und 17 Schutzgebiete (4 Landschaftsschutzgebiete, 4 geomorphologische, 4 hydrographische, 3 botanische, 1 telmologisches und 1 urbanes) ausgewiesen.

Das Totalreservat Budragaidis umfasst den namensgebenden Moorsee mit Schwingrasen mit umliegenden Wäldern und Magerrasen sowie einen naturbelassenen Abschnitt des Flüsschens mit vielen geschützten Pflanzenarten.

In den Landschaftsschutzgebieten steht unter Schutz: Anyksciu silelis umfasst den namensgebenden Wald, das Tal der Sventoji mit Aufschlüssen und Auenwiesen, die riesigen Findlinge Puntukas und deren Bruder, die Quelle „Schwingrasen der Königin“, die Geburtsstätte von A. Vienuolis in Azuozeriai, das Hügelgräberfeld Peniankai; Elme umfasst das Tal des Flüsschens Elme und Bereiche des Tals der Sventoji mit zahlreichen Quellen in der Nähe und naturnahe Wiesen, den Burghügel Seimyniskeliai, die archäologische Siedlung und die alten Gräber; Storiai umfasst die Moräne von Storiai mit den Hügeln Geguzines, Storiai, Liepkalnis, Sibiriakas und Baltramas sowie das Grab von Jonas Biliunas, den Burghügel Liudiskiai mit der archäologischen Siedlung; Virinta umfasst das Tal der Virinta mit Terrassen und einem mäandernden Flusslauf mit Furten und Kolken und Aufschlüssen von Sand und Ton aus dem Devon, weißem Quarzsand aus dem Neogen, mit Laichplätzen von Forellen und biologisch wertvollen Wiesen.

In den geomorphologischen Schutzgebieten steht unter Schutz: Gojus moräne Hügelkette; Janydziai charakteristisches Relief erodierender Hügel mit Kerbtälern und Mäanderspornen; Judinis hohe Erosionskare mit zahlreichen Kerbtälern; Kurkliai hohe Kare mit zahlreichen Kerbtälern.

In den hydrographischen Schutzgebieten steht unter Schutz: Anyksta ein naturbelassener Abschnitt des Flusses Anyksta mit charakteristischer Struktur des Flussbetts und der Gutshof Burbiskis; Rubikiai die Seenplatte aus den Seen Rubikiai, Dusynas, Linikas und Musejus mit Inseln und Uferbereichen; Sventosios senvages ein Abschnitt der Sventoji mit zahlreichen Altarmen, Karstseen und Feuchtgebieten; Varius ein naturbelassener Abschnitt im Unterlauf des Flüsschens mit Aufschluss und dem Findling von Pavariai.

In den botanischen Schutzgebieten steht unter Schutz: Gecioniai typische Pflanzengesellschaften der Laub- und Mischwälder mit vielen geschützten Arten von Pflanzen, Vögeln und Pilzen; Varius seltene Pflanzengesellschaften und Arten im Tal der Sventoji; Vilkatenai Pflanzengesellschaften des Waldes von Vilkatenai aus alten Kiefern mit Beimengungen von Fichte und Birke und geschützten Pflanzenarten..

Im telmologischen (Moor) Schutzgebiet Pakalniai wird der Teil der Senke mit den verlandenden Seen Pabirzyte und Ezerine und geschützten Pflanzen und Tieren unter Schutz gestellt.

Die Altstadt von Anyksciai gilt als urbanes Schutzgebiet zum Erhalt der historischen Teile der Stadt und ihrer Struktur (Planung und räumlich), der traditionellen Bebauung, kulturell wertvoller Objekte und Umgebung und architektonischer Formen.

Im Regionalpark Anyksciai gibt es 18 staatlich geschützte Objekte des Naturerbes, 10 davon als Naturdenkmäler. Die wichtigsten Naturdenkmäler sind der riesige Findling Punktukas (Stein von Dvaronys) und dessen Bruder (Stein von Pasventupys), die Quelle Schwingrasen der Königin und die Aufschlüsse von Varius und Vetygala. Der Punktukas ist zudem ein Denkmal und immobiles Kulturerbe. Im Regionalpark befinden sich 131 Objekte des Kulturerbes.