Vilkų duobės gylis 8 – 10 m, ilgis – 75 m, plotis – 40 m, plotas – 0,21 ha. Tai vakarų-rytų kryptimi šiek tiek ištęsta taisyklingo piltuvo formos duobė. Jos dugne kaip ir aplik duobę slūgso geltonas įvairaus grūdėtumo smėlis su reta žvirgždo priemaiša. Duobės dugne yra senų kasinėjimo žymių. Duobė sausa. Pagal turimą geologinę medžiagą ir pagal bendrą geologinės situacijos analizę galima daryti prielaidą, kad tai glaciokarstinė duobė. Kitaip sakant, paviršius šioje vietoje „prasmego“, ištirpus po smėliu palaidotam ledo luistui. Ši duobė sausa todėl, kad paviršinis vanduo smėlingose nuogulose čia slūgso žymiai giliau, negu yra duobės dugnas. Grabijolų kaimo gyventojo L. Medekšos (g. 1926) pasakojimas: „Už upės yra didelė gili duobė. Tėvas sakė, kad mano prosenelis ten kasė, tai net plytas iškasinėjo, tokias dideles, raudonas. Iš Kernavės ten tunelis buvo, iki Vilniaus buvo padarę. O kai išsilaužė tas tunelis, tai duobė atsirado“.