Iškelta iš marių dugno. Pirmą kartą medinė, šiaudais dengta Rumšiškių bažnyčia paminėta 1677 m., tačiau ji sudegė. Dabartinė Rumšiškių bažnyčia pastatyta 1707 m., perstatyta 1859–1860 m. 1958 m. statant Kauno hidroelektrinę, apatinėje Nemuno terasoje stovėję pastatai perkelti į aukštesnę vietą, beveik nepakeitus buvusios architektūros. Bažnyčios archaiškumą liudija senosios tikybos pėdsakus išlaikiusios dvi poros kvadratinių stulpų su aukštais pjedestalais ir žalčių galvomis dekoruotais kapiteliais. Presbiteriją skiria dailininko V. Didžioko piešta juosta, kurią laiko du angelai. Bažnyčią ir varpinę perkeliant į kitą vietą, maždaug 0,4–0,6 m gylyje rastas degėsių sluoksnis. Tai rodo, kad bažnyčia statyta senosios vietoje. Po didžiuoju altoriumi 1 m gylyje rasta mūrinio plytų – akmens kripta. Triaukštė medinė varpinė statyta maždaug 1700 m., pilaitės pavyzdžiu. Varpinės sienos iš tašytų rąstų, dauguma – iš kedro medžio, o naujesni sienojai – pušiniai. Šventovėje gražiai bei švariai skamba vertingi nežinomo autoriaus romantinio laikotarpio vargonai.