Miestelio centre įsikūrusiame muziejuje pamatysite šiuolaikiškai įrengtą ekspoziciją, bylojančią apie krašto žmonių gyvenimą nuo akmens amžiaus iki šių laikų. Čia turėsite galimybę prisiliesti prie Merkinės rotušės varpo, išgirsti pasakojimus apie Merkinės pilies ir miesto laikus, karaliaus V. Vazos mirtį Merkinėje 1648 m., Lietuvos partizanų įvykdytą Merkinės puolimą 1945 m. ir kitas šio krašto istorijas. Merkinės muziejui priklauso V. Krėvės Mickevičiaus memorialinis muziejus Subartonyse ir Perlojos istorijos muziejus.