Tik dalyje Juodlės ežero telkšo atviras vanduo, kitur veši tankūs nendrynai, kuriuose slepiasi paukščiai. Nemažą buvusio ežero dalį užima pelkė. Todėl Juodlė išsiskiria paukščių įvairove. Paukščius patogiausia stebėti nuo naujo tilto. Tyliai įsitaisius ir turint kantrybės, galima pamatyti ir išgirsti įvairių rūšių paukščių. Tinkamiausias jų stebėjimo laikas – nuo balandžio iki liepos. Ežere galima pamatyti besislapstančių ančių, kragų, čia užskrenda upinės žuvėdros ir rudagalviai kirai, pasitaiko gulbių, apsilanko garniai. Virš nendrynų ratus suka nendrinės lingės, nendrynuose gieda didžiosios ir mažosios krakšlės, ežerinės nendrinukės, cirena nendrinės startos. Pelkėje trimituoja gervės, mekena perkūno oželiai. Vakarop iš nendrynų pasigirsta duslus didžiojo baublio balsas.