Die Karstseen Kirkilai sind besonders attraktiv aufgrund ihrer gewundenen Ufer, malerischen Halbinseln, Meerengen, Buchten und Inseln. Die Karstseen Kirkilai bilden ein einzigartiges Element der Landschaft, das einzige seiner Art im Baltikum. Aufgrund der besonderen hydrologischen und hydrochemischen Bedingungen sind die Fauna und Flora dieser Seen einzigartig. In Karstseen wurden 46 Zooplanktonarten gefunden. Die Forscher des Instituts für Botanik haben die außergewöhnliche ökologische Struktur dieses Sees entdeckt. Seine Einzigartigkeit wird durch das an Calciumsulfationen reiche Wasser und seine Schichtung nach Temperatur und Sauerstoffgehalt bestimmt. Daher ist es reich an sulfatreduzierenden Schwefelbakterien, deren violette Ansammlungen manchmal mit bloßem Auge sichtbar sind. Aufgrund dieser Einzigartigkeit sind die Seen in Gebietsnetz „Natura 2000“ eingetragen.