Der Regionalpark Nemunas-Delta dient dem Erhalt der Landschaft des Deltas des Nemunas. Unter Schutz stehen dadurch:

• das System der Mündungsarme (Atmata, Pakalne, Skatule, Skirvyte, Vytine, Vorusne usw.) des Nemunas, die Insel Rusne, das Kap Vente und die Landschaft Zalgiriai, abgetrennte Altarme und die als Lagune entstandene Bucht Kroku lanka, die Auwiesen am Unterlauf des Nemunas;
• der alte Teil des Städtchens Rusne, das Dorf MInija, der Leuchtturm von Uostadvaris, alte Schleusen und die Einrichtungen der Polder;
• Stabilität des Ökosystems, die biotischen Komponenten, die spezifische Pflanzen- und Tierwelt, wichtige Plätze für das Brüten von Wasservögeln und Rastplätze für Zugvögel, Migrationsrouten und Laichplätze von Fischen.

Landschaft des Deltas des größten Flusses in Litauen mit zahlreichen, teils durchflossenen Altarmen. Der charakteristische See Kroku lanka, die Bucht Kniaupo ilanka, die Mündungsarme im Delta, die Insel Rusne mit dem niedrigsten Ort im Land, natürliche Auwiesen am Unterlauf des Nemunas. Hier gibt es die größte Population des weltweit gefährdeten Seggen-Rohrsängers. Das Moor Aukstumala ist die Wiege der Moorkunde. Ein wichtiger Ort auf der Strecke der Zugvögel. Hier wurde ein einzigartiges System von Poldern geschaffen. Einzigartig ist auch das Kulturerbe, das Dorf Minija gilt als das litauische Venedig, die Leuchttürme von Vente und Uastadvaris, das Dorf Skirvytele und das Städtchen Rusne. Und die Lebensart ist eine andere, ganz besonders bei regelmäßig auftretendem Hochwasser.

Der Regionalpark Nemunas-Delta befindet sich im Nordosten des Großen Deltas (Rusne-Gilija) und repräsentiert die ethnokulturelle Region Klein-Litauen (Memelland). Einen besonderen Platz in der Landschaft des Regionalparks nimmt der Mündungsarm Rusne (der Hauptarm im Delta) mit seinen weiteren Verzweigungen ein, sowie das Kap Vente mit seinem großen touristischen Potenzial.

Die landschaftliche Vielfalt des Regionalparks Nemunas-Delta wird hauptsächlich aus diesen Landschaftstypen gebildet: bewaldetes und sumpfiges Vordelta, intensiv bewirtschaftete und veränderte Winter-Polder, bewirtschaftete Sommer-Polder, bewirtschaftete und waldarme flach geneigte Talränder, bewirtschaftete Täler, bewaldete oder kultivierte Auen im Delta, flache Lagunen, sumpfige, kaum bewirtschaftete Terrassen des Littorina-Meeres, bewirtschaftete Moränehügel, verlandende Buchten des Haffs, seichtes Haff und Dörfer am Haff.

Der Regionalpark Nemunas-Delta ist als zu schützendes Feuchtgebiet gemäß der Ramsar-Konvention gelistet. Durch den Regionalpark verläuft eine bedeutende Vogelzugroute Paläarktis-Europa-Afrika.

Von der Europäischen Union geschützte Lebensraumtypen (Bezeichnung und EU-Code): 1130 Ästuarien, 1150 Lagunen des Küstenraums, 2330 Dünen mit offenen Grasflächen, 3160 Dystrophe Seen und Teiche, 3270 Flüsse mit Schlammbänken, 6120 Trockene, kalkreiche Sandrasen, 6450 Auwiesen, 7110 Lebende Hochmoore, 7120 Degradierte, renaturierungsfähige Hochmoore, 9080 Laubholz-Bruchwälder, 91D0 Moorwälder, 91E0 Auwälder mit Schwarzerle Ein großer Teil der Fläche wird von Auwiesen und Laubwald eingenommen.

Die Gesamtzahl der Pflanzenarten liegt bei 680, davon wurden 25 in die Rote Liste von Litauen aufgenommen. Die Gesamtzahl der Tierarten beträgt 750. 49 Säugetiere, von denen 3 von der EU geschützt sind und 13 in die Rote Liste von Litauen aufgenommen wurden. 307 Vögel, von denen 62 von der EU geschützt sind und 67 in die Rote Liste von Litauen aufgenommen wurden. 48 Fische, von denen 9 von der EU geschützt sind und 5 in die Rote Liste von Litauen aufgenommen wurden. 16 Amphibien und Reptilien, von denen 2 von der EU geschützt sind und 3 in die Rote Liste von Litauen aufgenommen wurden. 330 Wirbellose, von denen 1 von der EU geschützt ist und 18 in die Rote Liste von Litauen aufgenommen wurden.

Zur Bewahrung der natürlichen und kulturellen Schätze des Regionalparks Labanoras wurden 2 Totalreservate und 25 Schutzgebiete (3 Landschaftsschutzgebiete, 4 hydrographische, 2 botanische, 1 ichthyologisches, 1 ornithologisches, 7 botanisch-zoologische, 4 telmologische, 1 ethnokulturelles, 1 architektonisches und 1 urbanes) ausgewiesen.

In den Totalreservaten steht unter Schutz: Medziokle-Moor – Landschaft eines bewaldeten Moores im Nemunas-Delta mit geschützten Tieren und Pflanzen (Rasenbinse, Sphagnum molle, Traunsteiners Knabenkraut, Seeadler), FFH-Lebensraumtypen in Mooren und Wäldern; Vordelta des Nemunas – Territorium und Gewässer, wo natürliche Prozesse der Deltabildung sehr aktiv ablaufen, besondere Flora und Fauna des Deltas (Europäische Seekanne, Rohrdommel, Rohrweihe, Wiesenweihe, Seeadler, Tüpfelsumpfhuhn, Kleines Sumpfhuhn, Wachtelkönig, Säbelschnäbler, Kampfläufer, Doppelschnepfe, Zwergmöwe, Flussseeschwalbe, Trauerseeschwalbe, Zwerg- und Weißbart-Seeschwalbe, Uhu, Sumpfohreule) mit den typischen Biozönosen, FFH-Lebensraumtypen am Meer mit den geschützten Tierarten (Atlantischer Lachs, Bitterling, Steinbeißer, Rapfen, Fischotter und Schlammpeitzger).

In den Landschaftsschutzgebieten steht unter Schutz: Polder Pakalne – Landschaft eines Sommerpolders mit zahlreichen Armen des Nemunas, älteste Schleuse in Litauen, Leuchtturm Uostadvaris, geschützte Vogelarten (Rohrdommel, Rohrweihe, Wiesenweihe, Seeadler, Tüpfelsumpfhuhn, Kleines Sumpfhuhn, Wachtelkönig, Säbelschnäbler, Kampfläufer, Doppelschnepfe, Seggen-Rohrsänger, Gartenammer), Brutplätze und Rastplätze von Zugvögeln (Singschwan, Pfeifschwan, Blässgans und Graugans, Weißwangengans, Pfeifente, Spießente, Sichelente, Schnatterente, Löffelente, Seeadler; Vente – Hafflandschaft und Relief der Moräne, geschützte Pflanzenarten (Strand-Dreizack, Geflecktes Knabenkraut), Route von Zugvögeln, Kulturerbe; Dorf Zalgiriai – Dorf einer Moorkolonie und Besonderheiten der Landnutzung.

In den hydrographischen Schutzgebieten steht unter Schutz: Leite – Struktur des Flüsschens Leite bis einschließlich Mündung, Biozönose der Insel Ragininkai, geschützte Arten (Bitterling, Teichfledermaus, Steinbeißer, Rapfen, Große Moosjungfer, Fischotter, Schlammpeitzger); Leitgiriai – charakteristische Struktur des Flüsschens mit den für kleine Täler typischen Biozönosen, geschützte Arten (Teichfledermaus, Steinbeißer, Große Moosjungfer, Schlammpeitzger); Totarme des Nemunas – für das Delta des Nemunas typische Altarme, Buchten und durchflossene Seen, Flussdünen mit geschützten Arten (Kanten-Lauch, Schlangen-Lauch, Teichfledermaus, Steinbeißer, Rapfen, Große Moosjungfer, Fischotter, Schlammpeitzger), FFH-Lebensraumtypen in Wiesen, Dünen und Binnengewässern; Tenenys – ausgeprägte Struktur des Tenenys mit sumpfigem Tal und naturnahen Wiesen, geschützten Pflanzenarten (Traunsteiners und Geflecktes Knabenkraut) und Tiere (Atlantischer Lachs, Teichfledermaus, Große Moosjungfer, Fischotter, Schlammpeitzger).

In den botanischen Schutzgebieten steht unter Schutz: Galzdonai – Landschaft am Nemunas mit geschützten Pflanzen (Echter Wiesenhafer, Kanten- und Schlangen-Lauch) und FFH-Lebensraumtypen in Wiesen und Dünen; Leitgiriai – Bruchwälder mit geschützten Pflanzen (Tannenbärlapp, Verschiedenblättrige Kratzdistel) und FFH-Lebensraumtypen in Wäldern.

Im ichthyologischen NSG Minija steht die Minija als wichtige Migrationsroute für Fische und als Laichplatz unter Schutz, zudem geschützte Tiere (Atlantischer Lachs, Teichfledermaus, Steinbeißer, Rapfen, Große Moosjungfer, Fischotter).

Das ornithologische NSG Uostadvaris dient dem Schutz von Brutplätzen geschützter Vogelarten (Rohrdommel, Wiesenweihe, Rohrweihe, Kleines Sumpfhuhn, Säbelschnäbler) und von Rastplätzen von Zugvögeln (Singschwan, Pfeifschwan, Blässgans, Graugans, Weißwangengans, Haubentaucher, Pfeifente, Spießente, Löffelente, Schnatterente, Sichelente, Gänsesäger und Zwergsäger, Brachvögel).

In den botanisch-zoologischen NSG steht unter Schutz: Berstai – Moorwald mit den charakteristischen Pflanzenarten (Rasenbinse, Sphagnum molle) und FFH-Lebensraumtypen in Wäldern; Kniaupas – seichte Bucht des Haffs mit Brutplätzen von Vögeln, Laichplätzen von Fischen und geschützten Pflanzen (Seekanne), FFH-Lebensraumtypen in Küstenbereichen, geschützte Vögel (Zwergmöwe, Flussseeschwalbe, Zwerg-, Trauer- und Weißbart-Seeschwalbe, Singschwan, Pfeifschwan, Blässgans und Graugans, Weißwangengans, Haubentaucher, Pfeifente, Spießente, Löffelente, Schnatterente, Sichelente, Zwergsäger und Gänsesäger, Brachvögel), Fische (Bitterling, Steinbeißer, Schlammpeitzger) und Säugetiere (Teichfledermaus, Fischotter); Kroku lanka – Hydrobiozönose des aus einer Lagune entstandenen Sees mit geschützten Tieren und Pflanzen (Rohrdommel, Rohrweihe, Seeadler, Kleines Sumpfhuhn, Singschwan, Pfeifschwan, Blässgans und Graugans, Weißwangengans, Haubentaucher, Pfeifente, Spießente, Schnatterente, Löffelente, Sichelente, Gänsesäger und Zwergsäger, diverse Brachvögel, Bitterling, Teichfledermaus, Steinbeißer, Fischotter, Schlammpeitzger); Kulynai – Moor- und Bruchwald mit geschützten Pflanzen (Baltisches Knabenkraut) und Tieren (Seeadler); Altarme der Minija – typische Pflanzengesellschaften von Wiesen und Wäldern im Tal der Minija mit geschützten Arten (Seeadler, Bitterling, Teichfledermaus, Steinbeißer, Große Moosjungfer, Fischotter) und FFH-Lebensraumtypen in Wäldern und Wiesen; Sausgalviai – Brutplätze geschützter Vögel (Wachtelkönig, Kampfläufer, Doppelschnepfe, Trauerseeschwalbe, Seggen-Rohrsänger), andere geschützte Tiere (Große Moosjungfer, Fischotter, Schlammpeitzger); Sysa – Brutplätze der global gefährdeten Vogelarten Seggen-Rohrsänger und Doppelschnepfe, weitere geschützte Tiere (Rohrweihe, Tüpfelsumpfhuhn, Wachtelkönig, Alpenstrandläufer, Kampfläufer, Singschwan, Pfeifschwan, Blässgans, Graugans, Weißwangengans, Pfeifente, Spießente, Schnatterente, Löffelente, Sichelente, Zwergsäger, Gänsesäger, diverse Brachvögel, Große Moosjungfer und Schlammpeitzger) und der FFH-Lebensraumtyp Auwiesen.

In den telmologischen NSG steht unter Schutz: Aukstumala – Reste des Moorkomplexes Aukstumala mit Moorkolken, spezifischen Pflanzengesellschaften und geschützten Tieren (Große Moosjungfer, Seeadler, Sumpfohreule, Sphagnum molle und Sphagnum imbricatum, Rasenbinse, Schlankes Wollgras, Glockenheide) und FFH-Lebensraumtypen in Binnengewässern, Mooren und Wäldern; Kintai – Moorkomplex; Medziokle-Moor – eines der größten, botanisch sehr wertvollen Moorgebiete in der Region, umgeben von Poldern, FFH-Lebensraumtypen in Mooren und Wäldern; Rupkalviai – Rupkalviai-Feuchtgebiet mit geschützten Pflanzen (Rasenbinse, Geflecktes Knabenkraut) und Tieren (Seeadler, Uhu, Teichfledermaus, Große Moosjungfer) und FFH-Lebensraumtypen in Mooren und Wäldern.

Im ethnokulturellen Schutzgebiet des Dorfes Skirvyte steht das Dorf Skirvyte (Ortsteil von Rusne) als eines der am besten erhaltenen und ethnographisch wertvollen Fischerdörfer von Klein-Litauen unter Schutz mit seiner Struktur, Bebauung und Architektur, Objekten des Kulturerbes und Umgebung sowie die ethnischen Traditionen und die Lebensweise.

Im architektonischen Schutzgebiet Minge (Minija) steht das ethnographisch wertvolle Fischerdorf Minija, teils Straßendorf, teils Flussdorf, mit seiner Struktur, Bebauung und Architektur unter Schutz.

Das urbane Schutzgebiet Rusne dient dem Erhalt des historischen Teils der Stadt Rusne nach Stadtplanung, Architektur und Bausubstanz mit der spezifischen Bebauung der Grundstücke und traditionellen architektonischen Lösungen und weiteren Kulturobjekten und Umgebung.

Im Regionalpark Nemunas-Delta gibt es 1 Objekt des Naturerbes, die Hermann-Sudermann-Eiche, und 120 Objekte des Kulturerbes.